Ogni intervento chirurgico comporta dei rischi. Ogni tecnica chirurgica presenta possibili effetti collaterali e complicazioni. I più comuni effetti collaterali che incorrono nell'immediato periodo post-operatorio sono:

• Dolore
• Ipersensibilità alla luce
• Visione confusa durante la cicatrizzazione
• Correzione insufficiente
• Correzione eccessiva
• Abbagliamento
• Opacizzazione corneale
• Fenomeni di diffrazione della luce
• Astigmatismo indotto
• Fluttuazioni della visione

Questi effetti collaterali solitamente diminuiscono non appena è avvenuta la cicatrizzazione. L'oculista può suggerire un ulteriore intervento per correggere l'ipocorrezione o l'astigmatismo indotto. Si possono avere anche delle complicazioni in seguito a chirurgia refrattiva. Mentre complicazioni serie sono molto rare, le seguenti possono a volte essere presenti:

• Infezioni
• Complicanze intraoperatorie
• Insufficiente cicatrizzazione
• Astigmatismo irregolare persistente
• Visione instabile
• Ipercorrezione progressiva